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以脂多糖（Lipopolysaccharide，LPS）刺激Raw264.7细胞产生肿瘤坏死因子α（Tumor necrosis factor α，TNF-α）为模型体系，建立了非天然氨基酸代谢掺入法检测特定新生成蛋白的方法。通过代谢掺入的方法，使细胞中的蛋白质，特别是新生成的蛋白质一级结构中掺入非天然氨基酸，即带有叠氮基团的甲硫氨酸类似物（Azidohomoalanine，AHA）。考察了在不同浓度的LPS和FBS，以及不同的刺激时间等条件下，LPS刺激Raw264.7细胞产生TNF-α的实验参数，确定了最优的实验条件为：在含有1%胎牛血清的无甲硫氨酸（Met）的DMEM培养基中，分别在不加LPS和加10 ng/mL的LPS条件下刺激Raw264.7细胞4 h，在刺激细胞的同时掺入AHA。利用Cu⁺催化的叠氮基团与带有生物素（Biotin）标签的炔烃基团的环加成反应，使蛋白质标记上Biotin标签。利用吸附在固相载体上的抗体特异性捕获TNF-α分子，再用耦联辣根过氧化物酶（Horseradish peroxidase，HRP）的链霉亲和素（Streptavidin）对TNF-α分子上的Biotin进行识别，实现对特定的新生成蛋白质（TNF-α）进行检测。本方法为检测特定微量新生成蛋白、表征特定蛋白质的周转等研究提供了新的思路法。

酰基-生物素置换法（Acyl-biotinyl exchange，ABE）是利用生物素取代棕榈酸，进而对棕榈酸修饰的蛋白进行标记检测的方法，是检测S-棕榈酰化蛋白质的常用方法。本研究比较了ABE法中丙酮沉淀与甲醇-氯仿沉淀两种方法对S-棕榈酰化蛋白检测的影响，并对小鼠心脏组织中S-棕榈酰化修饰蛋白进行整体分析，进一步丰富S-棕榈酰化蛋白质的相关研究。首先用N-乙基马来酰亚胺（NEM）对小鼠心脏组织中蛋白质分子上的游离巯基进行封闭，再利用巯基反应性生物素化试剂（HPDP-Biotin）对羟胺（HA）切割后新产生的半胱氨酸巯基进行生物素标记，可检测出小鼠心脏组织中S-棕榈酰化修饰的蛋白。在此反应过程中，均通过蛋白沉淀法除去未反应的NEM、HA及HPDP-Biotin。基于不同沉淀方法对小鼠心脏组织总蛋白中的S-棕榈酰化蛋白进行标记后，利用链霉亲和素修饰琼脂糖珠对已标记上生物素的S-棕榈酰化蛋白进行富集，利用质谱检测分析。本研究共鉴定出50种S-棕榈酰化蛋白，其中丙酮沉淀实验组鉴定出23种S-棕榈酰化蛋白，甲醇-氯仿沉淀实验组鉴定出37种S-棕榈酰化蛋白，两组均鉴定出的蛋白有10种，不同的沉淀方法交叉互补使用可使鉴定结果更加丰富、可靠。

一价铜催化的叠氮炔基的特异性反应通常被称为"点击化学反应"。点击化学反应作为一种重要的分子连接方式，能够在分子水平实现特定小分子基团之间的简单高效连接。因其快速高效、选择性高、条件温和、副反应少等优点，在蛋白质组学分析中有广泛应用，包括新生成蛋白的鉴定和多种翻译后修饰蛋白的鉴定等方面。因此，深入研究点击化学反应在蛋白质组学中的反应机制，对理解蛋白质的结构功能具有重要意义。本文综述了近年来点击化学反应在蛋白质组学中的几类重要应用，并对其未来的发展趋势进行了展望。